Massiv erstatning av multidrug-resistente patogener mellom mennesker, husdyr og ville dyr

For å revurdere forekomsten og overføringen av multidrugresistente patogener
Utveksling av patogener mellom mennesker, husdyr og ville dyr har en betydelig innvirkning på spredning av antibiotikaresistens, ifølge resultatene av en internasjonal studie som involverer forskere fra Freie Universität Berlin og Robert Koch Institute (RKI). Forskerne publiserte sine studieresultater i tidsskriftet "PLoS Genetics".

Forskerne fant at "en globalt forekommende, multidrugsresistent ESBL-produserende E. coli-variant kan overføres vesentlig mellom mennesker, husdyr og ville dyr", ifølge RKI. Dette er hva analysene av patogen-familietreet viste. Utvekslingen mellom de forskjellige artene har derfor en betydelig innflytelse på spredning av multidrugresistente patogener.

Forskere fant at multirestiale patogener sirkulerer mellom mennesker, vill og husdyr. (Bilde: JackF / fotolia.com)

Stamtavleanalyser uunnværlig for infeksjonskontroll
I tillegg til forskere ledet av Alan McNally av Nottingham Trent University har tatt Sebastian Gunther og Catherine Schaufler fra Freie Universität Berlin og president Robert Koch Institute, Lothar H. Wieler, deltok i studien. Ved hjelp av en ny bioinformatisk metode ble forskerne i stand til å representere patogenes stamtavle i en tidligere uovertruffen høy oppløsning. Slike "stamtreanalyse (fylogenetisk analyse) er avgjørende for å fortsette utviklingen, fordeling og overføring av patogener og antibiotisk resistens og forbedre infeksjonskontroll," rapporterer RKI.

Patogener sirkulerer mellom mennesker, dyr og kjæledyr
I den nåværende studien analyserte det internasjonale forskerteamet utvekslingen av såkalte ESBL-produserende E. coli-bakterier mellom mennesker, husdyr og husdyr. Forskere har lenge sagt at "patogenene - og arvelige egenskaper som gjør motstand mulig i utgangspunktet - sirkulere mellom mennesker, dyr og miljø", sier RKI. Et eksempel på dette er multidrug-resistente ESBL-produserende E. coli-bakterier, som danner spesielle bakterielle enzymer (såkalte Extended Spectrum Beta-Lactamases, ESBL) og dermed inaktivere forskjellige antibiotika.

Analyser av det nukleare genomet samt tilbehøret og regulatorisk genom
Mer enn 200 isolater av en bestemt ESBL-produserende E. coli-variant (sekvens type 131; ST131), som stammer fra forskjellige land og verter, ble analysert av forskerne. For deres studier kombinerte de for første gang den detaljerte analysen av det nukleare genomet med analysen av tilbehøret og regulatorisk genom, rapporterer RKI. Genomet beskriver helheten av all arvelig informasjon av en organisme, og det nukleære genomet forekommer hos alle representanter for en art. I tillegg er det imidlertid flere gener som kan variere, som i sin helhet er referert til som tilbehørsgenomet. I tillegg kan bakterier "kontrollere deres genom på en målrettet måte" og "områdene som er ansvarlige for dette kalles regulatorisk genom," forklarer RKI.

Se på patogenes utvikling
Kombinasjonen av analysen av alle tre genomregionene gjorde det mulig for forskerne, i henhold til sin egen uttalelse, å se på enestående løsning i utviklingen og distribusjonen av disse patogenene. I prinsippet blir "molekylær overvåkning, den komplette undersøkelsen av patogengener, og analysen av utvikling og spredning, i infeksjonskontroll, stadig viktigere," sa RKI. Multidrugsresistente gramnegative bakterier (MRGN) vil i større grad true medisinsk fremgang i human og veterinærmedisin. En viktig forutsetning for molekylær overvåkning er kraftige sekvenser og ekspertisen til bioinformatikere. (Fp)